نظرا لما توليه حكومة خادم الحرمين الشريفين – يحفظه الله – من اهتمام بالغ في نشر التعليم و المعرفة و لما فيه من دعم للخدمات الصحية في كافة انحاء المملكة, لقد أنشأت كلية الصيدلة في جامعة الحدود الشمالية في مدينة رفحاء – منطقة الحدود الشمالية عام 1429هـ الموافق 1429هـ (2008م) بموجب القرار السامي رقم 5150/م ب في 21/11/1428هـ (1/12/2007م) وقرار وزارة التعليم العالي رقم 24/49/1429هـ المنعقدة بتاريخ 2/4/1429هـ الموافق 8/4/2008م. تتضمن الكلية الأقسام الأكاديمية التالية: قسم علم الأدوية والسموم، قسم الصيدلانيات, قسم الممارسة السريرية, قسم الكيمياء الصيدلية و قسم العقاقير والطب البديل. تمتد مدة الدراسة في الكلية إلى 6 سنوات، تبدأ بسنة تحضيرية وتنتهي بسنة امتياز. يحصل الخريجون منها على شهادة دكتور الصيدلة. يهدف برنامج دكتور الصيدلة في جامعة الحدود الشمالية إلى تجهيز الطلاب ليصبحوا ممارسين متميزين في مجال الصيدلة، حيث يعملون كأعضاء فعّالين في فرق الرعاية الصحية وأيضاً ليشغلوا مستقبلاً أدواراً تتطلب مهارات ومعارف الصيدلي. يحرص البرنامج التعليمي على تأهيل الطلاب لأداء واجباتهم ليس فقط كمتخصصين بل أيضاً كمواطنين مطلعين تماماً على التغيرات الحديثة في مجال الرعاية الصحية. تظهر نتائج التعليم المخطط له في الابتكار ونشر المعارف الحديثة حول الأشكال والمستحضرات الصيدلانية المختلفة ودورها في نظام الرعاية الصحية المتقدمة في المملكة. تُعد اللغة الإنجليزية هي لغة التدريس والتقييم للمقررات، ومدة البرنامج تمتد لست سنوات دراسية مقسمة إلى 12 مستوى. في السنة الأولى، يدرس الطلاب مقررات السنة التحضيرية لكليات الصحة، بينما في السنة السادسة (سنة الامتياز: فصلين دراسيين بالإضافة إلى فصل صيفي) تنقسم الدراسة إلى دورات تدريبية إكلينيكية، بعضها إلزامي وبعضها اختياري تحت إشراف مشترك بين الكلية وفريق طبي مختص من جميع التخصصات التشخيصية والعلاجية في المستشفيات التعليمية. خلال السنوات الأربع المتبقية، يقوم الطلاب بدراسة بقية مقررات العلوم الأساسية والصيدلانية المتخصصة، بالإضافة إلى ساعات التدريب الصيفي في الصيدلة، التي تُقسم على فترتين، حيث يتضمن كل منها 6 ساعات يُمنح الخريج بعدها درجة "دكتور" في الصيدلة.