انطالقاً من اهتمام وزارة التعليم العالي بالتوسع في نشر التعليم الجامعي في جميع مناطق المملكة حسب التوجهيات السامية بهذا الخصوص فقد تم إنشاء كلية الصيدلة برفحاء ككلية من كليات جامعة الحدود الشمالية في عام 1429هـ - 2009 م ونظراً لحاجة المدينة و ما جاورها من قرى و هجر لزيادة فرص التعليم. و تضم الكلية األقسام العلمية التالية: قسم علم األدوية والسموم، قسم الصيدلة السريرية، قسم الصيدالنيات، قسم العقاقير و الطب البديل، قسم الكيمياء الصيدلية و قسم العلوم الطبية األساسية )تحت التأسيس( بحيث تتكون الدراسة بالكلية من 6 سنوات تبدأ بالسنة التحضيرية و تنتهي بسنة االمتياز. و يحصل المتخرج على درجة دكتور الصيدلة. ويهدف برنامج دكتور الصيدلة بجامعة الحدود الشمالية إلى إعداد طالبه لبدء الممارسة الصيدلية الجيدة كأعضاء مؤثرين في عمل فريق الرعاية الصحية الجيدة وكذلك للقيام مستقبالً بأدوار مهارية أخرى تتطلب قدرات الصيدلي ومعارفه العلمية. ويحرص البرنامج التعليمي على إعداد طالبه للوفاء بدورهم ليس فقط كمهنيين ولكن أيضا كمواطنين على علم تام ودراية بالمتغيرات الحديثة في مجال الرعاية الصحية. ونتائج ما خطط له من تعليم يبدو جلياً في ابتكار ونشر المعارف الحديثة حول األشكال والمستحضرات الصيدالنية المختلفة ودورها في نظام الرعاية الصحية المتميزة بالمملكة. و تعتبر اللغة اإلنجليزية هي لغة التدريس والتقييم المقررات ومدة البرنامج ست سنوات دراسية موزعة على 12 مستوى وفي السنة األولي يدرس الطالب مقررات السنة التحضيرية لمسار الكليات الصحية وأما في السنة السادسة )سنة إمتياز: فصلين دراسيين باإلضافة لفصل صيفي( تكون الدراسة موزعة على دورات تدريبية إكلينيكية بعضها إجبارية وأخرى اختيارية تحت توجيه وإشراف مشترك من الكلية وفريق طبي متخصص من كافة التخصصات التشخيصية والعالجية بالمستشفيات التعليمية. أما في السنوات البينية األربع فيدرس الطالب باقي مقررات العلوم األساسية والصيدالنية المتخصصة ؛ باإلضافة لساعات التدريب الصيدلي الصيفي على فترتين لكل فترة 6 ساعات مقررة ويمنح الخريج درجة "دكتور "الصيدلــة.